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上海交大构建 AI 原生科学实验室 AutoDNA 装置:实现自主分子生物学实验操作,成果登《自然》

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来源:ithome.com
IT之家 11 月 8 日消息,上海交通大学计算机学院 IPADS 实验室陈海波、王肇国团队与化学化工学院、变革性分子前沿科学中心樊春海、王飞团队合作,依托张江高等研究院 DNA 存储研究中心开展研究, 成果发表于《自然》(Nature)杂志 ,并获该刊官网首页头条重点报道。 研究团队构建了 AI 原生科学实验室 AutoDNA 装置(思源一号),实现了自主分子生物学实验操作 ,通过对模型、实验与仪器进行协同设计,解决了现有 AI 自主科学实验室向分子生物学实验拓展时,在复杂流程组织、多类仪器协同以及实验时序、环境稳定性和操作精度保障等方面面临的难题,使自主实验能够覆盖需要微米级定位和微升级液体处理的复杂生物分子实验场景。 据介绍,已有 AI 自主科学实验室通常由专家预先配置仪器、规定实验流程和设定优化规则,再将人工智能接入文献检索、方案生成或数据分析等局部环节。这种“外挂式”架构虽能提升单个环节的效率,却难以适应生物分子实验流程复杂、仪器类型多样,以及对实时执行、环境稳定和操作精度要求严格等特点。为此, AutoDNA 采用 AI 原生架构,通过模型-实验-仪器协同设计的思路解决上述问题 。 针对实验流程复杂的问题 ,AutoDNA 结合对适用于复杂生物分子操作的实验过程理解,构建了面向实验的多智能体架构。系统将复杂实验任务分解为文献检索、试剂选择、方案设计、代码生成、硬件执行、结果分析和迭代优化等环节,并根据实验进展组织多个专业智能体协同工作,使模型能够贯通“设计 — 实验 — 优化”全过程,并依据实验结果持续迭代调整后续方案。 针对仪器种类多、跨设备协作困难的问题 ,Au